月経が正常で妊娠検査が陰性の場合、妊娠していないことが確認できますか？

結論

いいえ。

月経が通常通りにあり、腹痛や出血といった月経時の症状が見られ、かつ妊娠検査が陰性であれば、妊娠していないと判断できます。