CNSマップをCCP4形式に変換する方法

CNSは大学グループが開発した結晶学・NMR解析用プログラム群で、マップの作成・解析が可能です。CCP4も同様の機能を持つソフトウェアですが、ファイル拡張子が異なります。ここでは、MAPMAN(USF提供)を用いてCNSマップをCCP4形式に変換する手順を紹介します。

手順

  1. MAPMAN を起動し、上部メニューの「Command Line」を選択します。コマンド入力画面が表示されます。

  2. 1行目に read m1 ${prefix}_1fofc.map CNS と入力し、${prefix} を変換したいCNSマップのフルパス(拡張子なし)に置き換えて Enter

  3. 次の行に read m2 ${prefix}_2fofc.map CNS と入力し、2番目のマップのパスを指定します。変換したいマップが複数ある場合は同様に read m3 … と追加してください。

  4. 続けて write m1 ${prefix}_1fofc.map CCP4 と入力し、保存先のパス(拡張子なし)を指定して Enter。他のマップも同様に write m2 … などと記述します。

  5. 最後に quit と入力し Enter。プログラムが実行され、指定したフォルダにCCP4形式のマップが生成されます。生成されたファイルはCCP4で開いて確認してください。

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