アガロースゲルを染色する方法

核酸またはタンパク質の視覚化は、アガロースゲル電気泳動の実行に不可欠です。ゲルを染色せずに作業すると、テストしているサンプルがどこに到達したかを確認できないため、たとえば分子サイズの測定値は厳しく制限されます。 DNAまたはRNA分子に挿入すると紫外線(UV)光下で蛍光をかける臭化エチジウム(ETBR)などの一般的でよく誤った色素を使用してゲルを染色します。染料は、サンプルの分子を濃い青のマークとして表示することにより、実験を実行するのに役立ちます。

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必要なもの

  • 安全手袋とゴーグル
  • アガロースゲル
  • 臭化エチジウム
  • ピペット(少量のギルソン)
  • バッファーの読み込み
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手順

    • 1

      薄いが保護的な安全手袋を着用し、指と手を無制限に動かすことができます。小さなピペットを使用して、容器からETBR(または同等の染色)を引き出します。

    • 2

      選択した染色のミリリットルあたり0.5マイクログラムをサンプルに追加します。サンプルをカバーし、手動で混ぜます。いくつかのシェイクで十分です。

    • 3

      ピペットを使用して、マイナス充電された負荷バッファーをミックスに追加します。これにより、自然光で肉眼で染色されたサンプルを見ることができ、それ以外の場合は興味のある分子を分解する高価で有害な紫外線が排除されます。キシレンシアノールは一般的に使用される荷重バッファーですが、他には利用可能です。測定している分子と同じ速度で実行されるロードバッファーを選択してください。キシレンシアノールは、長さが5000塩基対(BP)であるDNAフラグメントと同じ速度で走行します。

    • 4

      クリーンピペットを使用して、アガロースジェルの開始時に拡張サンプルをウェルに適用します。適用するボリュームは、ゲルコームのサイズ(十分な厚さと長さ、ゲルの厚さ)に依存します。コントロールではなくサンプルを染色して、興味のあるパラメーター(分子量など)を正しく効果的に決定できるようにします。

    • 5

      または、サンプルを視覚化する方法としてサザンブロッティングを実行します。 DNAをニトロセルロース膜に移します。ハイブリダイゼーションプローブにさらします。これは染色されていませんが、Access Excellenceによって説明されているように、適切な代替手段を提供します。



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