DNAの磁気抽出について
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磁気ビーズ?
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DNAの抽出には一般的に使用されています。労働力を節約する機械プロセッサを含む各システムには、独自のブランドが付属しているため、特定のシステム用に設計されたビーズのみを使用する必要があります。さまざまなデバイスで使用すると、ビーズのサイズとコーティングが結果を変えることができ、研究の信頼性が低下します。特別に作られた代替案でさえ、実験的なエラーを増やすことができ、特定のビーズで抽出器が作業するように作られていない場合、結果を報告するときに開示する必要があります。
研究でシステムを「混合して一致させる」必要がありますか?
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さまざまなビーズを使用するシステムは、結果に影響を与える可能性があります。ヘンダーソン等。 Invitrogen™によるDynabeads®DNADirect™は、テストされた9つのビーズタイプのうち、幾何学的にねじれた緊張を持つDNAのみを拾うことができるという結論に達しました。これは、磁化されたビーズがDNAの大きなビットのみを保持していることを意味します。さらに、DNAは(溶液中)自由に浮かび上がらなければならないと述べられました。また、この状態は、特定の状況下で使用するためにそれを支配します。しかし、これはまた、この製品が、高分子量DNA(大きな部分)を低分子量DNA(「分解」、小型、または壊れた部分)から分離する良い方法であることを意味します。結局のところ、これらすべてのものは、これらの製品の特性を最適に使用する方法を決定するのは常に研究者次第です。
DNA抽出に磁石を使用する理由
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この新しい方法は、物事をより複雑にすることができます(ロジスティック)が、磁気抽出方法を含む研究の大部分はまだコントロールと比較としてフェノールを使用していますが、通常、自動化による実験的エラーを減らすことで速度と精度の改善を示しました。さらに、磁気アプローチは、実行あたりのDNA収量を増やすことで研究資金の有効性を改善できる自動化された手段を通じて、可逆的固定化に役立ちます。
コーティング
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磁気ビーズには、1つのタイプのタンパク質用に特異的に設計された抗体でコーティングされている可能性のあるさまざまなタイプがあります。または、コーティングまたはアミン、カルボキシル、または他の適切なグループでより一般化される場合があります。磁石の化学的コーティングが問題の化学物質を結合すると、ビーズに縛られた化学物質は、単純な磁石によって急速に除去できます。
サイズは重要ですか?
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サイズは、小さなビーズで増加する表面積のために結合を許可する時間の量などの特性に影響します。小さなビーズのもう1つの利点は、粒子がより細かく、より簡単に分散できるため、より良い懸濁液になることです。マイクロサイズのビーズは、ナノサイズの仲間よりもはるかに大きい(時には15000倍も大きい場合もあります)(より多くの費用がかかります)
コスト
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このプロセスの欠点は、5mlがショップで400ドル以上を実行できるため、ナノビーズにかなりの費用がかかることです。マイクロサイズのビーズは、約3分の1のコストでかなり安くなる可能性がありますが、作業はよりゆっくりと動きます。
遠心管
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遠心管を保持し、多くの完全な遠心管で一度に分離することを可能にする磁気分離器が利用可能です。これらのいくつかは、一度に材料でいっぱいの最大24以上の遠心分離機チューブの質量容量を保持しますが、他のものは一度に2つしか保持していません。磁石は通常、マルチチューブバージョンに中央に位置し、チューブの下または下にあります。これらのチューブを遠心分離機に置くと、磁気分離プロセスを支援できるビーズの密度が高いため、理にかなっています。詳細情報は、ウェブまたは地元のサプライヤーを通じて入手できます。
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