扁桃腺摘出後でも喉に溶連菌感染は起こりますか？

はい。溶連菌性咽頭炎は、A群溶血性レンサ球菌（Streptococcus pyogenes）によって引き起こされる細菌感染です。

たとえ扁桃腺を摘出していても、喉の他の部位にこの細菌が付着し、感染することがあります。その結果、溶連菌性咽頭炎が発症する可能性があります。