アルカリ溶解理論
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なぜアルカリ性溶解
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アルカリ溶解プロトコルは、プラスミドDNAを含む細菌ペレットに追加された一連の溶液で構成されています。溶液のアルカリ度の増加により、細胞が破裂します。この抽出方法は、ゲノムDNAを破壊し、細胞タンパク質を変性させ、科学者に比較的純粋なサンプルを提供しながら、プラスミドDNAを保護します。
SDSおよびNAOH
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アルカリは、個々の細胞の溶解を引き起こすために使用される2つの主要な化学物質を説明しています。ドデシルナトリウム(Lauryl)硫酸(SDS)は、細胞膜に穴を開けることで細胞を不安定にした洗剤です。水酸化ナトリウム(NAOH)は細胞壁を分解し、細胞を崩壊させ、遺伝物質を溶液に放出します。
プラスミドDNAが生き残る理由
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アルカリ性溶解プロトコルにおけるNaOHの追加特性は、DNA塩基対間の水素結合を破壊することです。これにより、ゲノムDNAとプラスミドDNAが単一鎖に変性します。溶液に酢酸カリウムを添加すると、アルカリ性が中和され、小さなプラスミドDNAが溶液に再生成して溶解することができます。ゲノムDNAは大きすぎて、その全長を再生成できません。それと変性したタンパク質は、遠心分離中に沈殿し、プラスミドDNAを溶液中に残します。
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