DNAゲル電気泳動法を比較する方法

ゲル電気泳動は、電流を使用してゲルを介してDNA、RNA、またはタンパク質を分離する標準的な技術です。分子の電荷を使用して、電流を使用してゲルで分離します。

1. アガロース

   • アガロースゲルは、DNAを視覚化するための最も一般的な方法です。視覚化するDNAのサイズに応じて、アガロースの異なる割合を使用できます。 0.7％などのアガロースの割合が低いと、大きなDNAフラグメントを視覚化する解像度があります。 2パーセントなどの高い割合は、DNAの小さな断片を視覚化するためによく使用されます。 DNAを視覚化するために、UV光のDNAや蛍光と互いに挿入する際に臭化エチジウムがよく使用されます。

   ポリアクリルアミド

   • ポリアクリルアミドゲルは、最大1 kbの10塩基対までのDNAフラグメントを分離するために使用されます。これらのゲルの分離範囲は小さくなりますが、高解像度があります。ただし、準備はより複雑です。また、解像度に影響を与えることなく大量のDNAをロードすることも可能です。アガロースと同様に、臭化エチジウムはDNA断片を視覚化するためによく使用されますが、ポリアクリルアミドは蛍光を消すことができ、少量のDNAを視覚化することが困難になります。

   パルスフィールド

   • この形式の電気泳動は、大きなDNA分子を分離するために使用され、しばしばジェノタイピングに使用されます。大きなDNAフラグメントは同様の速度で移動します。したがって、さまざまなバンドを解決することは難しい場合があります。パルスフィールドの電気泳動は電界を交互にします。これにより、DNAのより大きな分離と解像度が可能になります。

   毛細血管

   • 毛細管電気泳動は、DNAを分離するための迅速で敏感な方法です。少量のDNAを解決できます。 DNAは、蛍光標識またはUV光を使用して視覚化できます。

   変性

   • DNAの分離は、その構造によって複雑になる可能性があります。 DNAの融点を下げることにより、尿素とホルムアミドを使用して構造を破壊する可能性があります。これは、アガロースとポリアクリルアミドの両方のゲルで使用できます。

   考慮事項

   • 選択された電気泳動法は、分離するDNAフラグメントのサイズに依存します。分離後にDNAの使用方法も最終的な方法を決定します。