腸内細菌検査の方法

腸管内に存在する様々な細菌（腸内病原体）は、腸疾患を引き起こすことがあります。感染症の診断では、病原性細菌と腸内に常在する正常菌を区別する必要があります。そのため、臨床検査室では培養、免疫学的検査、特殊染色、炭水化物利用試験、分子生物学的検査などを組み合わせて診断を行います。

培養検査

培養は便サンプルから細菌を同定する最も信頼性の高いゴールドスタンダードです。便の一部を様々な栄養培地を含むペトリ皿に inoculate し、細菌の栄養要求や増殖パターンから腸内細菌種を特定します。

免疫学的検査

特定の細菌種に対する抗体を利用した検査です。便の少量をスライドに置き、抗体溶液を加えると、対象細菌が存在すれば凝集が観察されます。

特殊染色

顕微鏡下で細菌の形態や染色性を観察します。代表的なのはグラム染色で、腸内の多くの正常菌はグラム陰性（ピンク）に、Clostridium などの病原性菌はグラム陽性（紫）に染まります。

炭水化物利用試験

細菌は利用できる炭水化物が種ごとに異なります。便サンプルを異なる炭水化物を含むチューブに入れ、細菌が代謝すると生成物が酸性を変化させ、色の変化で判定します。

分子生物学的検査

近年主流となっているのは、細菌の遺伝子情報を検出する分子生物学的手法です。培養が困難な場合でも、便中に残っている DNA／RNA があれば PCR などで検出できます。