ゲル電気泳動のトラブルシューティング

必要なもの

ゲル電気泳動の最終工程である染色から逆算して確認する。染色剤は適切なバッファーで十分に溶解させ、規定濃度で使用することが重要です。
電源を確認する。電流・電圧が高すぎるとサンプルがゲル外へ流出しバンドが消失する。低すぎるとサンプルが移動しない、またはウェルから拡散してしまう。
ポリアクリルアミドゲルのアクリルアミド濃度を確認する。一般的に5〜15％の範囲で使用し、分子サイズに応じて適切な濃度を選択する。大分子は低濃度（5％）で、小分子は高濃度で分離する。
アクリルアミドの重合に使用する試薬（APS、TEMED）を確認する。APSが過剰だと重合が速く進み、過少だと不完全または不均一になる。添加後約15分でゲルが固まることを目安とする。
サンプルのロード量を確認する。濃度が高すぎるとバンドがぼやけ、低すぎると染色感度の限界で検出できないことがある。
サンプルの品質を確認する。塩分や不純物は電流の伝導性を変え、サンプルの移動に影響する。純度の高い抽出法や精製キットを使用すること。
使用したPAGEの条件が文献やプロトコルと合致しているか確認する。アクリルアミドの％や電源設定、走行速度など、実験条件が適切か再チェックする。