戦闘や逃走反応時に消化器系は活発になりますか？

いいえ、戦闘や逃走反応（ファイト・オア・フライト）では消化器系はむしろ活動が低下します。

闘争・逃走反応が起こると、体は血流とエネルギーを緊急事態に必要な筋肉や脳へ優先的に供給し、消化といった非必須機能への供給を抑制します。その結果、消化器官の活動は遅くなり、場合によっては一時的に停止することさえあります。