シーケンシャルチッププロトコル

SeqChipとして知られる連続クロマチン免疫沈降は、2つのタンパク質がデオキシリボ核酸（DNA）鎖の1つの領域内で相互作用する方法を定義することを目的とした生物学的試験です。研究者は、特定の一連の順序付けされたタスクに従事し、評価中のタンパク質間の3つの可能な関係を明らかにします。ほとんどの科学テストと同様に、それは掃除と存在し、結論で終わります。ハーバード大学の研究者によると、SEQCHIP分析における技術的進歩により、科学者はより広く生物学的現象を研究できるようになる可能性があります。

1. 準備

   • SEQCHIP実験には、実験のために磁気ビーズを消毒してきれいにするための慎重な準備が含まれています。研究者は、ビーズを複数回洗浄し、「ブロック」ソリューションで掃除する必要があります。その後、ビーズは乾燥のために吊り下げられ、再洗浄されます。一般的に、科学者は、リンク段階に進む前に、最後の洗濯の前に去ります。評価のためのさまざまなDNA鎖の性質を考えると、この準備の段階は複雑さも異なります。ただし、1つの科学的真実が残っています。テストがきれいになるほど、結果がきれいです。

   クロスリンク

   • 科学者は、抗体による強化のために、DNAタンパク質複合体または鎖の領域を選択します。実際には、生物学者はタンパク質を並置して相互作用を観察します。一度観察されると、クロスリンクを逆の順序で確認する必要があります。シーケンスが逆になったとき、タンパク質はまだ関連していますか？ SEQCHIPの科学者は、反対方向に評価されたときに両方のタンパク質の共存が完全な共有の説得力のある証拠を提供し、部分占有率と共占有のない明確な区別を許可すると考えています。

   浄化

   • ポリメラーゼ連鎖反応、または「PCR」は、DNAの品質または純度をチェックするDNA増幅プロセスです。 PCRは3つの段階で実施されます。まず、PCRは温度を上げることでストランドを溶かします。次に、研究者は2つのテンプレートストランドをPCRプライマーと一緒に戻します。最後に、生物学者はDNAをインキュベートして、ポリメラーゼプライマーが検査中の細胞をクラスター化するようにします。そこから、研究者はクラスターの検査に移動します。

   評価

   • 分析では、タンパク質間のインタラクティブな関係である「占有」の有無に関するDNA鎖を調べます。常に同じDNAフラグメントと常に関連する2つのタンパク質は、完全な共存を持っています。タンパク質がDNA鎖の相互に存在するサブポピュレーションにのみ関連することができる場合、共占有は発生しません。部分的な共有とは、一部のDNA分子が両方のタンパク質を持っていることを意味し、他のDNA分子はどちらか一方を持っていることを意味します。 SEQCHIPテストが生物学の鎖における1つの手順である場合、科学者にゲノム構造全体に特異な結果を適用する可能性を提供します。